萬里區衛生所在日據時代已成立，民國40年（西元1951年）7月成立萬里鄉衛生所野柳巡迴站，緣於偏遠地區人才難求，設備簡陋老舊，難以普及醫療保健服務。為謀求改善，行政院衛生署於民國72年（西元1983年）試辦群體醫療執業中心，萬里鄉也於民國74年（西元1985年）8月7日開辦群醫中心(含牙科)，其開辦之初，委託長庚醫院基隆分院支援，使正規的醫師人力進駐萬里，擔任衛生所主任。

此後本所開始推動衛生所3項系統架構作業，包括一般行政(人事、會計、出納、總務、政風)的兼辦業務、衛生專業(保健、防疫、公共衛生、預防醫學、衛生行政)工作及基金作業(醫療門診)系統，15人中，正式人員10人，大多數為專業人士(包括醫師、護理師、醫檢師、放射師等)其餘5人為臨時人員，半數人員薪資由醫療門診基金支付，由於地處偏遠，居民外移，約2萬人口，高於65歲者佔全部15%以上，歷次調查(民國78年（西元1989年）臺北縣綜合開發計畫、民國79年（西元1990年）戶口及住宅普查、民國86年（西元1997年）萬里鄉社區健康評估)發現醫療資源不足及人口老化為本區2大健康問題，因此近10年來透過社區網絡，結合民間專業(護理、藥劑等)人力及勸募醫療設備，來補充醫療資源之不足，並加速投入中老年疾病防治工作。

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